Aglaé et Juju, nos deux Super Super, redoublent d'efforts dans ce nouveau tome pour aider toutes les personnes dans le besoin, humains comme animaux, adultes comme copains de classe. Dans ce nouveau tome, Aglaé et Juju viennent tour à tour au secours d'un éléphant retenu captif dans un cirque, d'une dessinatrice dont les planches se sont envolées, ou de leurs camarades qui se font harceler. Des enjeux de taille pour nos petits héros, qu'ils affrontent en se serrant les coudes... car qui dit amitié magique, dit aventures magiques !

Juin 1693. L'été est si pluvieux à Paris que Mme de Pompignan propose à Cécile de la suivre avec Luis à Montpellier. Là-bas, Cécile rencontre la femme du duc de Nouailles qui lui fait part de son inquiétude pour son mari. Ce dernier doit sauver le soldat Picard, blessé au front, qui ne doit pas tomber aux mains de l'ennemi. Grimée en soldat, Cécile rejoint la ligne de front pour soigner le soldat.

De retour à l'Académie royale, les élèves ont la surprise de faire leur rentrée de nuit parce que leur professeur d'astronomie est un noctambule. Pour le premier cours, il propose d'observer une comète magique passant au-dessus du château. Migali est ravie d'avoir une nouvelle mission et voit là une occasion supplémentaire de faire des bêtises.

1793, Nantes et ses environs basculent dans le chaos révolutionnaire. Alors que Mélina et Léocadie partent à la recherche de Célénie en croisant paysans insurgés et forces républicaines, Mange-Doigts tente de la faire reconnaître comme héritière. Mais l'insurrection royaliste, à laquelle participe Enguerrand, promet d’allumer l’étincelle qui embrasera toute la région.

Grâce au secret des chaînes d'Andromède, Chronos est parvenu à libérer Prométhée. Le Titan révèle que le feu de l'Olympe est enfermé à Blue Graad, dans la grotte sacrée de Kitej, que seule Athéna peut ouvrir. Saori se rend justement à Kitej pour y déposer l'urne dans laquelle est emprisonnée l'âme de Poséidon, qu'il vient de vaincre.

Pour lui remonter le moral, Snow, Fizz, San et leurs amis emmènent Ajax au cinéma pour découvrir le nouveau film de son idole, Magic Eddy. Mais ils se retrouvent embarqués dans une aventure aux confins de la galaxie, durant laquelle ils doivent s'unir pour sauver tous les animaux de l'Univers, ainsi que Mortelle Adèle.

A l'école de magie, les sorcières se réunissent au sujet du pouvoir d'Evelÿne, qui est désormais capable de maîtriser la magie de l'éther et ainsi guérir les créatures maléfiques. De son côté, Evelÿne tente d'en savoir davantage sur ses origines et sur la sorcière qui détenait les mêmes pouvoirs qu'elle, une certaine Mélyne Noirdejais.