La prophétie s'est réalisée car sur Dune, la planète des sables, le désert s'est transformé en jardin. Mais, du coup, l'épice de prescience vient à manquer. L'antique Abomination ressurgit du passé et tente de prendre le pouvoir. Leto Atréides doit se battre dans un combat sans merci, non plus pour posséder la prescience, mais bien l'immortalité.

Dans des mondes futurs, Atréides et Harkonnens se disputent l'exploitation de l'épice sur Dune, planète hostile peuplée de Fremens et d'immenses vers attirés par les impulsions des moissonneuses. Alors que les cruels Harkonnens complotent avec l'empereur, Paul Atréides, le fils du duc Leto, semble être le messie attendu par les Fremens.