Au VIe siècle, les trois petits-fils de Clovis se partagent la Gaule mérovingienne. Lorsque la femme de Chilpéric, Galswinthe, meurt assassinée, sa soeur la reine Brunhilde d'Austrasie envoie le jeune Arsenius Pontius à Rouen enquêter sur ce drame. Il reçoit l'aide de Wintrude, princesse thuringienne devenue esclave des Francs, tandis qu'un conflit gronde entre la Neustrie et l'Austrasie.

En juillet 1789, alors que la Bastille tombe, le journaliste Gabriel Joly découvre l'identité du Loup des Cordeliers. Mais celui-ci disparaît. Se lançant à sa poursuite, Gabriel se rend en Corse, sur les traces de la Main rouge, une société secrète qui tente d'influer sur la Révolution en cours.

Appelé à Tours par son parrain l'évêque Grégoire, le jeune Arsenius Pontius doit élucider divers événements mystérieux avec l'aide de sa compagne Wintrude, de la disparition d'un clerc à celle d'une relique, en passant par l'assassinat d'une religieuse, dont le cadavre est retrouvé au fond d'un puits.