Cela fait maintenant une vingtaine d'années que des monstres d'origine inconnue, baptisés Kaiju, sont arrivés sur Terre. Depuis qu'elle a découvert que l'agressivité de ces monstres pouvait être calmée et maîtrisée grâce à la voix de certaines jeunes filles, l'espèce humaine a décidé d'essayer de cohabiter avec eux. L'école pour filles de Tatara propose ainsi comme option d'apprentissage le métier très particulier de « dresseuse » de Kaijus. Ion Hidaka, élève de sixième, a justement choisi de débuter ce cursus peu ordinaire. Élue dès la rentrée comme membre du club d'élevage , elle doit également s'occuper tous les jours du monstre gigantesque qui vit dans la forêt derrière l'établissement.