Une histoire au coeur de la nature australienne, dont les principaux protagonistes sont des kangourous, des opossums et des koalas.

Shredder met au défi ses hommes de main de lui livrer les Tortues ninja. Le binôme qui y parviendra restera dans son équipe tandis que les autres connaîtront un triste sort. Une guerre sans merci s'engage alors pour capturer les Tortues.