La nuit, sur les docks, les Tortues ninja combattent Zodiac, un groupe dirigé par Shredder et composé d'animaux inspirés des signes astrologiques chinois. Mais il manque le signe du rat, ce qui inquiète maître Splinter.

A Brooklyn, dans les années 50. En l'absence de sa mère, Lennie, qui avait prévu de passer un week-end entre amis, doit s'occuper de son frère de 7 ans, Joey. Pour se libérer du petit, il lui joue un tour et simule un accident de carabine sur un terrain vague. Persuadé d'avoir causé la mort de son frère, Joey s'enfuit à Coney Island, immense plage new-yorkaise dédiée aux manèges et à l'amusement. Il passe une journée d'errance au milieu de la foule et des attractions...

Au Libéria, pays d'Afrique ravagé par la guerre, le docteur Miguel Leon, médecin humanitaire, et le docteur Wren Petersen, directrice d'une ONG, tombent passionnément amoureux l'un de l'autre. S'ils sont tous les deux engagés corps et âme dans leur mission, ils n'en sont pas moins profondément divisés sur les politiques à adopter pour tenter de régler le conflit qui fait rage.

Le canal du Midi est en danger ! De terribles champignons microscopiques surnommés "chancrignons" attaquent les arbres. Si tous disparaissent, les animaux du canal devront chercher de nouveaux abris. Accompagnée de Cluque, l'intrépide Violette Mirgue doit retrouver le trésor de Riquet pour arrêter les champignons et sauver les habitats de tous ces petits animaux . Mais avant, il faut rassembler tout le petit peuple du canal...