Début du XVIe siècle. Porté par son rêve de découvrir les confins du monde, Ferdinand de Magellan, navigateur portugais épris de liberté, convainc la Couronne espagnole de financer une expédition audacieuse pour atteindre l'archipel des Moluques et ses îles aux épices par l'Ouest. Mais le voyage se transforme en un périple éprouvant : la faim, les tempêtes et les mutineries mettent l'équipage à genoux. Lorsque Magellan atteint enfin les îles de l'archipel malais, l'explorateur idéaliste s'efface pour laisser place à un conquérant obsédé par la domination et la conversion, provoquant des soulèvements violents.